Hesaplamalı Biyoloji

Biyologlar, veri analizi ve matematiksel modellemeyi kullanarak, biyolojik davranışları anlamak ve tahmin etmek için MathWorks ürünlerini kullanabilirler.

MathWorks ürünleri; farmakokinetik (PK), biyoinformatik, sistem biyolojisi, biyomedikal görüntü işleme ve biyoistatistik için tek ve entegre bir ortam sağlar.

MathWorks hesaplamalı biyoloji ürünlerini kullanarak şunları gerçekleştirebilirsiniz:

Verileri içe aktarma, analiz etme, modelleme ve sonuçların paylaşımı.
İş akışlarını otomatikleştirme.
Keşfedilmemiş araştırma alanlarıyla çalışmak ve yenilikçi yöntemler geliştirmek için algoritmaları ve araçları özelleştirme.
Kanıtlanmış, ticari olarak desteklenen algoritmalardan ve araçlardan yararlanma.

Hesaplamalı Biyoloji için Veri Analizi

Hesaplamalı biyoloji için entegre bir ortam sağlayan MathWorks ürünleri; veri aktarımı, veri analizi ve sonuç paylaşımı için ayrı veya uyumsuz araçlarla çalışma ihtiyacınızı ortadan kaldırır.

Doğrusal olmayan karma etkiler, sıralama, mikroçip, filogenetik ağaç, kütle spektrometrisi ve gen ontolojisini içeren çeşitli analizler yapabilirsiniz.
Verileri birden fazla kaynaktan, veri tabanlarından veya donanımlardan alabilirsiniz.
Otomatik olarak oluşturulan HTML raporları, veri görselleştirmelerini veya bağımsız araçları kullanarak sonuçları paylaşabilirsiniz.
Hesaplama süresini azaltmak için paralel veri analizi gerçekleştirebilirsiniz.
Hesaplama süresini azaltmak için paralel veri analizi gerçekleştirebilirsiniz.

Hesaplamalı Biyoloji için Matematiksel Modelleme

MathWorks ürünleri, farmakokinetik (PK) ve sistem biyolojisi gibi çeşitli modelleme türleri için birleşik bir ortam sağlar. Bu ortamda, biyolojik sisteminizle ilgili özellikleri öngörebilir, model oluşturabilir ve çeşitli analizler yapabilirsiniz. SimBiology’deki grafiksel ve programlı modelleme araçları, aşağıdaki işlemleri yapmanızı sağlar:

Harici verilerin analiz edilmesi ve görselleştirilmesi, PK Sihirbazı’ndan bir PK modeli belirleme ve modeli harici verilere uygun hale getirme
Bir sistemin dinamiklerini incelemek için bir tepki ağı uygulama
PK gibi modelleri biyokimyasal ağ ile birleştirme
Sonuçları otomatik olarak oluşturulan bir raporla paylaşma

Hesaplamalı Biyoloji’de Kullanılan Ürünler

Bioinformatics Toolbox

Next Generation Sequencing (NGS), mikroçip analizi, kütle spektrometrisi ve gen ontolojisi için algoritmalar ve uygulamalar sağlar. SAM, FASTA, CEL ve CDF gibi standart dosya formatlarından ve NCBI Gene Expression Omnibus ve GenBank gibi çevrimiçi veri tabanlarından genomik ve proteomik verileri okuyabilirsiniz.

Parallel Computing Toolbox

Parallel Computing Toolbox, çoklu çekirdek işlemcileri, GPU’lar ve bilgisayar kümeleri kullanarak hesaplama ve veri yoğunluğu olan problemleri çözmenize olanak tanır.

SimBiology

SimBiology, dinamik sistemlerin modellenmesi, simülasyonu ve analizi için uygulamalar ve programlama araçları sağlar. Kuantitatif sistem farmakolojisi (QSP), fizyolojik temelli farmakokinetik (PBPK) ve farmakokinetik/farmakodinamik (PK/PD) uygulamalarına odaklanmaktadır.